El programa de Preparatoria SEP con Habilitación Laboral, es un programa diseñado para alumnos con desafíos particulares. Este programa consiste en que el alumno curse las materias establecidas por la Secretaría de Educación Pública en una plataforma digital y con el apoyo de profesores titulares para cada materia, así como de maestros auxiliares, los cuales apoyan a los alumnos para que éstos adquieran los conocimientos y realicen los exámenes establecidos en el calendario de Preparatoria SEP.

Este programa también incluye cursos especiales de habilitación laboral que tienen como finalidad preparar a los alumnos para una vida productiva e independiente. Al finalizar, el alumno recibirá un certificado emitido por la Secretaría de Educación Pública, así como un diploma que avale su capacitación laboral.